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黑客帝国3中，史密斯被打败之后，他的真身为什么是1，2辑中的先知？
作为一部黑客电影，上面的人物大部分都是程序。而史密斯是一种病毒。可以这样理解：先知是程序，而史密斯这种病毒感染了她。尼奥把史密斯打败以后就相当于把先知身上的病毒清除，先知就回来了。
电影黑客帝国里，最后，先知的容貌为什么会变？
电影中先知解释过了，史密斯病毒已经变得太过强大，先知只能躲着他了，而最好的躲藏方式就是要把相貌改变。
而实际幕后的原因是，在一、二集中扮先知的老太太，第三集还没来得及演呢，就因为癌症去世了，所以只好另外换人，并在剧本中安插这么一段。
电影中，她亲自向墨菲斯一行人解释了相貌，后来法国人梅罗纹加也说到“那个老太婆现在肯定换了一副皮囊。
黑客帝国电影的几个问题
1.第一集的tank扮演者不愿出演第二部，所以换人了
2.先知的扮演者坐飞机失事了，不得已只好换人，电影里解释成换了躯壳逃避追捕
3.第二个问题太复杂，你可以去看一下百度的黑客帝国吧，或是一下这个帖子
黑客帝国三结尾矩阵清除史密斯后，为什么会出现先知？
史密斯在被尼奥终结后由于悖论（因为在尼奥终结史密斯前是史密斯杀了尼奥，而尼奥的“复活”又是程序设定以外的，所以本应该按程序已死的人反而杀死了杀他的人，这样系统就陷入一个死循环，既编的系统程序无法计算出史密斯被死人终结的结果，于是拒绝删除史密斯）成了一个病毒程序，他感染了先知程序，把先知程序变成了自己病毒程序的一个拷贝——就好像我们现在电脑里的正常文件被病毒感染后转成了病毒的帮凶一样。
尼奥被史密斯复制后获得了史密斯的原始代码，这样系统就可以通过把他们两个一起删除（就是计算为他们两个一起死亡）来结束系统死循环。也就是我们现在的杀毒＋修复Bug，把被感染的程序恢复到原样。于是被感染的先知程序就恢复原样了。
关于《黑客帝国》的几个问题。
你问的问题，几千字都解释不了，我只能简单说说
1.佩瑟芬是公爵梅罗纹奇的妻子，梅罗纹奇是MATRIX系统内的又一个超级神秘人物，他把自己象“先知”那样隐藏在系统中，如同回收站，收集非法程序，同时他也拥有改写系统程序的能力。但是，他并不是站在NEO这边。他住在矩阵系统内的一座城堡里，沉迷于一切奢华的东西。然而，他唯一缺少的便是感情；俗话说，得不到的才是最好的，他也最热衷于沉迷在感情的虚像里。佩瑟芬是这样一位Dracula公爵似人物的妻子。熟悉希腊神话的同志们都知道，佩瑟芬乃希腊神话中的“丰饶之神”，是主神宙斯和女神底米特之女，后来该仙女在玩耍的时候不小心被冥王哈第斯绑架，半推半就地做了后者的王后。电影中的佩瑟芬极其性感迷人，虽然她本身没有感情，但是只要她接触了某人，就会立刻感知对方的内心世界。但是她具体有什么能力，电影没说
2.史密斯感染了先知当然更强了，设计师都拿他没办法，只好让尼奥上马，玉石俱焚，但先知毕竟是主程序之一，事实上史密斯没有“消化”掉她，所以死了之后，先知的躯体又显露出来，史密斯感染先知后有了预知能力，可能感觉自己最后的失败，所以害怕
3.先知的扮演者飞机失事死了，所以换人，电影里就说她为了逃避机械城主的追杀换了躯壳
4.女孩是两个机械城程序的下一代，她也有主程序的代码，用我们的话说，是属于基因突变的天才，你说的继任者什么的电影均没有说明
5.这个问题太复杂了，牵涉到锡安的真实存在性，其实整部电影没有没有什么所谓虚拟和现实，都是虚拟的，锡安也是 我只能说，没有和平，历史将不断重现，因为这就是程序本身设计的
关于锡安的真实性，感兴可以参考这个帖子
最后我想说一下，黑客帝国的动画很好，能解释很多东西，是电影的一个补充，比如里面有一部全3G动画，超炫，而且还是黑客3的前传
黑客帝国里面的先知是否跳脱出了这个虚拟世界？
“先知”不是一个真实的人，她只是一段程序，类似于电脑中的“帮助”，她只是一段数据，并没有真实的身体躺在人体发电厂的营养液里，所以不可能离开梅曲克斯。。她就不是人